İşlemin kesin ve mutlak şekilde ağrısız yapılması gereklidir. İşlem sonrasi ağrı kontrolüne de destek sağlayacak uzun etkili bir lokal anestezik madde ile penis bölgesine enjeksiyon yapılmalıdır. Bu amaçla sünnette başlıca iki tip anestezi uygulanabilir:
- Lokal anestezi (Bölgesel, sadece penis ve çevresi uyuşturulur): Bebek dogduktan sonra 2 aylık olana kadar lokal anestezi ile rahatlıkla yapılabilir. Daha büyük cocuklarda lokal anestezi tercih edilmemelidir. Çocukta ciddi travmaya yol açabillir.
- Genel anestezi: Çocuk için en güvenilir yöntemdir. Ayrıca hem çocuk hem de cerrah açısından en konforlu yöntemdir. Sünnet, çocukların genellikle yaşamlarında ilk karşılaştıkları cerrahi işlemdir. Bu nedenle, çocuk üzerinde hem fiziksel hem de psikolojik açıdan en az etkiyi bırakacak yöntemlerin uygulanması gerekir ki bu da genel anestezi ile sağlanabilir. Hastalar genel anestezi altında sünnet olurken penis çevresi uyuşturulmakta ve hastalar operasyon sonrasınıda konforlu bir şekilde yaşamaktadırlar.